去年12月31日，碧生源发布公告称，将位于北京市西四环的碧生源大厦，即公司总部所在地，以5.55亿元的价格卖给了吉宝置业子公司。根据物业评估报告，碧生源大厦于去年11月30日经评估市场值为4.8亿元。此次碧生源出售子公司碧生源食品饮料有限公司，总价为1.25亿元，相比评估市场值亏损了3.55亿元。
据记者了解，和东阿阿胶一样，碧生源也在广告营销上进行了巨额投入，2009-2011年，研发费用仅占每年营收的0.3%、0.9%和2.3%。即便到2018年，其研发费用仅为2354.8万元，而广告营销费用则为24684.9万元，超出研发费用的十倍。
产品功效被质疑
此外，记者发现，随着消费者的健康意识逐渐提升，上述保健食品的功效和安全性也饱受质疑。
以东阿阿胶为例，2014年，北京协和医院肾内科主治医师陈罡，曾在自媒体丁香医生的微信公众平台上发表文章，名为《阿胶，被“神化”的水煮驴皮》。
陈罡在文章中写道：“总的说来，阿胶就是水煮驴皮，但熬制工序多了几分神秘。驴皮的主要成分是胶原蛋白，水煮驴皮后变成了部分水解和纯化的胶原蛋白。遗憾的是，水煮猪皮、羊皮或牛皮，都可以得到类似的胶原蛋白。从营养学上说，它无法满足人体对氨基酸的需求，并非良好的蛋白质来源，是一种劣质蛋白，在大多数国家的食品工业里仅作为添加剂使用。”
该文章曾引发激烈争论，但阿胶可以用来“补血”的说法，人民日报也通过官方微博表示，阿胶中的成分基本没有补血的功效。
碧生源的产品也曾引发争议。碧生源曾在《招股说明书中》提到，上市公司并不能完全保证产品不对消费者身体产生伤害。
对此，中国商报记者通过电话咨询其客服人员，该客服人员表示产品主要由植物成分组成，对身体没有害处。但记者了解到，产品的植物成分中有番泻叶，曾有多家媒体报道，长期服用此中药对身体有副作用。针对该成分的安全性问题，该客服人员却表示不会影响身体健康。
另外，据《国际金融报》报道，2006-2009年，碧生源每年均因“未经审批擅自发布”“虚假宣传”等被处罚。2007年—2010年，碧生源在北京、上海、广东、湖南、辽宁、江苏、内蒙古等地都曾因侵犯消费者肖像权、夸大功效、未获批文等原因被警告、停售或是撤销批文，经销商也有多次违规。
